Der Spielplan für die Saison 2013/2014 wurde von der Regionalliga-Kommission veröffentlicht. Für den FC Wacker Innsbruck II ergeben sich folgende Paarungen:
1 – 27. Juli 2013: FC Kufstein (H)
2 – 3. August 2013: SV Seekirchen (A)
3 – 10. August 2013: SCR Altach Amateure (H)
4 – 15. August 2013: WSG Wattens (A)
5 – 17. August 2013: FC Hard (H)
6 – 24. August 2013: Austria Salzburg (A)
7 – 31. August 2013: USC Eugendorf (H)
8 – 7. September 2013: SC Schwaz (A)
9 – 14. September 2013: FC Dornbirn (H)
10 – 21. September 2013: FC Anif (A)
11 – 28. September 2013: TSV Neumarkt (H)
12 – 5. Oktober 2013: SC Bregenz (H)
13 – 12. Oktober 2013: FC Höchst (A)
14 – 19. Oktober 2013: SV Wals-Grünau (H)
15 – 26. Oktober 2013: TSV St. Johann (A)
16 – 2. November 2013: FC Kufstein (A)
17 – 15. März 2014: SV Seekirchen (H)
18 – 22. März 2014: SCR Altach Amateure (A)
19 – 29. März 2014: WSG Wattens (H)
20 – 5. April 2014: FC Hard (A)
21 – 12. April 2014: Austria Salzburg (H)
22 – 19. April 2014: USC Eugendorf (A)
23 – 21. April 2014: SC Schwaz (H)
24 – 26. April 2014: FC Dornbirn (A)
25 – 1. Mai 2014: FC Anif (H)
26 – 3. Mai 2014: TSV Neumarkt (A)
27 – 10. Mai 2014: SC Bregenz (A)
28 – 17. Mai 2014: FC Höchst (H)
29 – 24. Mai 2014: SV Wals-Grünau (A)
30 – 31. Mai 2014: TSV St. Johann (H)
Die genauen Anstoßtermine werden jeweils wenige Wochen vor Spielbeginn festgelegt.
Die erste Runde im Rahmen des Tiroler Cupbewerbs mit schwarz-grüner Beteiligung wird am 27. August 2013 ausgetragen.